糜子PSY基因家族鉴定及生物信息学分析

农业科技通讯 ›› 2021, Vol. 0 ›› Issue (2): 196-202.

糜子PSY基因家族鉴定及生物信息学分析

张晋^1,2,3, 刘思辰^1,2,3, 曹晓宁^1,2,3

1.山西农业大学农业基因资源研究中心太原030031;
2.农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室山西太原030031;
3.杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室山西太原030031

发布日期:2021-03-02
作者简介:张晋（1984-）,男,助理研究员,从事种质资源创制及利用。通讯作者：曹晓宁（1985-）,男,博士,副研究员,从事种质资源创新利用及抗逆生理生态机制研究。电话：15834016832
基金资助:
山西省重点研发计划项目（201803D221020-6）; 国家现代农业产业技术体系建设专项（CARS-06-13.5-A16）; 山西省农业科学院农业科技创新研究课题（YCX2018D2BH3）; 杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室运行补助项目（201705D111008-32）; 山西杂粮产业技术体系（2020-03）

Published:2021-03-02

摘要/Abstract

摘要： 八氢番茄红素合成酶（PSY）是影响类胡萝卜素合成的首要限速酶。为了鉴定糜子中调控类胡萝卜素合成的PSY 基因,我们通过生物信息学的方法在糜子全基因组进行了同源比对,同时对糜子的PSY 蛋白进行了理化性质分析,以及对糜子PSY 基因的启动子区做了分析。结果表明,糜子全基因组中共有5个PSY 基因,所编码的PSY蛋白均为亲水性;亚细胞定位预测显示糜子PSY 蛋白可能定位于线粒体和叶绿体中;系统进化结果显示糜子PSY蛋白与谷子的PSY蛋白亲缘关系较近;在糜子PSY基因的启动子区包含激素类、光响应类、逆境胁迫类以及生长发育类响应元件。该基因家族的鉴定为研究调控糜子籽粒颜色深浅的相关机理提供理论基础,也为选育高类胡萝卜素糜子品种提供了参考依据。

张晋, 刘思辰, 曹晓宁. 糜子PSY基因家族鉴定及生物信息学分析[J]. 农业科技通讯, 2021, 0(2): 196-202.

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